More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8375 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8375  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
93 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  75.95 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  72.15 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  71.25 
 
 
115 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  67.5 
 
 
115 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  67.5 
 
 
115 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  67.09 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  67.5 
 
 
115 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  67.5 
 
 
115 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  65.82 
 
 
116 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0398  IS66 Orf2 like  65.82 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  67.09 
 
 
113 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3197  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 
116 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  62.5 
 
 
116 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 
116 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  65 
 
 
115 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2253  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556164  hitchhiker  0.00787404 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5014  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  61.25 
 
 
115 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  61.25 
 
 
115 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  51.22 
 
 
115 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  57.5 
 
 
115 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  59.76 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  59.76 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  59.76 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  59.76 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1338  IS66 family element, orf2  53.75 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3136  IS66 family transposase orfB  52.5 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2122  IS66 family orf2  52.5 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  53.66 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  56.96 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2590  putative transposase, TnpB  56.25 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  55.7 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  55.7 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  55.7 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0227  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  55.7 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  55.7 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  55.7 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3595  IS66 Orf2 family protein  56.63 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428006  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  52.44 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  52.44 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  58.23 
 
 
115 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5561  IS66 Orf2 family protein  56.58 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.440341 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3898  IS66 family transposase orfB  52.5 
 
 
116 aa  93.6  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  54.43 
 
 
115 aa  93.6  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>