17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5389 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5389  hypothetical protein  100 
 
 		 598 aa  1208    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1222  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 		 888 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0070  hypothetical protein  27.37 
 
 		 446 aa  72  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4275  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.411161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2935  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000152042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2034  hypothetical protein  28.21 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3080  hypothetical protein  26.6 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171333  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1755  hypothetical protein  27.56 
 
 		 336 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.459643  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2762  hypothetical protein  26.87 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4248  IgA peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M64  29.95 
 
 		 459 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4271  IgA peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M64  29.95 
 
 		 459 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  25.19 
 
 		 597 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4117  IgA peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M64  29.95 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2018  hypothetical protein  27.43 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.571015  normal  0.258757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  24.1 
 
 		 608 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3935  IgA peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M64  24.61 
 
 		 510 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819698  normal  0.416212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6715  hypothetical protein  25.1 
 
 		 353 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>