18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4696 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4696  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0776078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4695  hypothetical protein  56.72 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5063  hypothetical protein  46.58 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000118221  normal  0.831362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4204  hypothetical protein  41.77 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4165  hypothetical protein  41.77 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5729  hypothetical protein  61.76 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3360  hypothetical protein  39.02 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0032  hypothetical protein  40.85 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199385  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2573  hypothetical protein  39.73 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3359  hypothetical protein  46.77 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2076  hypothetical protein  44.07 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3002  hypothetical protein  38.03 
 
 
99 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3117  hypothetical protein  38.03 
 
 
99 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0045793  normal  0.84646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1972  hypothetical protein  42.37 
 
 
114 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0274003  normal  0.368977 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2004  hypothetical protein  34.29 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.50326  normal  0.486112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1903  hypothetical protein  41.86 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0638518  decreased coverage  0.00545954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0922  hypothetical protein  38.81 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3540  hypothetical protein  36.62 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>