20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3359 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3359  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5063  hypothetical protein  53.47 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000118221  normal  0.831362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3117  hypothetical protein  53.41 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0045793  normal  0.84646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3360  hypothetical protein  56.82 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3002  hypothetical protein  53.41 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1903  hypothetical protein  52.27 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0638518  decreased coverage  0.00545954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2076  hypothetical protein  52.78 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4165  hypothetical protein  54.93 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4204  hypothetical protein  54.93 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0032  hypothetical protein  52.31 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199385  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2573  hypothetical protein  49.23 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1305  hypothetical protein  42.62 
 
 
194 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4696  hypothetical protein  46.77 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0776078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1696  hypothetical protein  46.15 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000453326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1565  hypothetical protein  34.57 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62185  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1570  hypothetical protein  40.62 
 
 
139 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0137027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0218  hypothetical protein  43.21 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.632615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0922  hypothetical protein  36.23 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3006  hypothetical protein  31.17 
 
 
103 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20256  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4697  hypothetical protein  34.29 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>