14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3002 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3002  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3117  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0045793  normal  0.84646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3359  hypothetical protein  53.41 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1903  hypothetical protein  64.94 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0638518  decreased coverage  0.00545954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5063  hypothetical protein  49.35 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000118221  normal  0.831362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3360  hypothetical protein  51.35 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4165  hypothetical protein  53.03 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4204  hypothetical protein  53.03 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2076  hypothetical protein  46.27 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2573  hypothetical protein  52.46 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0032  hypothetical protein  44.07 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1305  hypothetical protein  39.68 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4696  hypothetical protein  38.03 
 
 
88 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0776078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1696  hypothetical protein  41.43 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000453326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>