14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1972 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1972  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  216  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0274003  normal  0.368977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1560  hypothetical protein  86.84 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4696  hypothetical protein  46.67 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0776078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5063  hypothetical protein  37.66 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000118221  normal  0.831362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3360  hypothetical protein  37.84 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4165  hypothetical protein  39.13 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4204  hypothetical protein  39.13 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3359  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2076  hypothetical protein  35.21 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2573  hypothetical protein  34.62 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4695  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1570  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3002  hypothetical protein  35.9 
 
 		 99 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3117  hypothetical protein  35.9 
 
 		 99 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0045793  normal  0.84646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>