14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5729 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5729  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4696  hypothetical protein  63.1 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0776078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4695  hypothetical protein  76.47 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4165  hypothetical protein  47.83 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4204  hypothetical protein  47.83 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5063  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  57.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000118221  normal  0.831362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3360  hypothetical protein  34.78 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0032  hypothetical protein  31.82 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2076  hypothetical protein  41.75 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3002  hypothetical protein  36.62 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3117  hypothetical protein  36.62 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0045793  normal  0.84646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2573  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3359  hypothetical protein  34.62 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1903  hypothetical protein  38.18 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0638518  decreased coverage  0.00545954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>