122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2168 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2168  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  320  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.797575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1327  hypothetical protein  46.53 
 
 
146 aa  143  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1661  protein of unknown function UPF0153  48.91 
 
 
174 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1608  hypothetical protein  47.52 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3918  hypothetical protein  46.9 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.871403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1392  hypothetical protein  47.59 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47410  hypothetical protein  46.9 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0895733  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4092  hypothetical protein  46.9 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1567  hypothetical protein  46.9 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1151  hypothetical protein  47.14 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.706631  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1776  hypothetical protein  52.99 
 
 
149 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.924435  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32930  hypothetical protein  53.57 
 
 
149 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2070  hypothetical protein  48.91 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4117  hypothetical protein  45.83 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0887  protein of unknown function UPF0153  47.1 
 
 
150 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0898  hypothetical protein  43.62 
 
 
153 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.211798 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0431  hypothetical protein  43.15 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1404  hypothetical protein  46.76 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3897  hypothetical protein  44.44 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4587  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2819  hypothetical protein  42.14 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3920  hypothetical protein  45.26 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0286797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2751  hypothetical protein  40.82 
 
 
148 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361359  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1626  hypothetical protein  44.83 
 
 
162 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0937096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2978  hypothetical protein  45.21 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1301  hypothetical protein  44.44 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0929  hypothetical protein  47.24 
 
 
154 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0890  protein of unknown function UPF0153  47.24 
 
 
154 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0895  hypothetical protein  45.77 
 
 
160 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0879  hypothetical protein  45.04 
 
 
163 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1114  hypothetical protein  46.72 
 
 
204 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95528  normal  0.301999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1024  hypothetical protein  45.07 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0291718  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1358  hypothetical protein  45 
 
 
147 aa  123  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2854  hypothetical protein  48.78 
 
 
157 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1790  hypothetical protein  44.76 
 
 
170 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0377386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1955  hypothetical protein  45.32 
 
 
169 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0453  protein of unknown function UPF0153  46.43 
 
 
170 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.604994  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2409  hypothetical protein  46.4 
 
 
206 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2421  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0029814  hitchhiker  0.00169444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0721  protein of unknown function UPF0153  47.5 
 
 
169 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1871  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00350248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1767  hypothetical protein  40.27 
 
 
157 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000753323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1898  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000382294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1905  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0367301  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1950  hypothetical protein  41.45 
 
 
153 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2010  hypothetical protein  41.45 
 
 
153 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220539  normal  0.187397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1953  hypothetical protein  41.45 
 
 
153 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0472193  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1506  hypothetical protein  41.45 
 
 
153 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2573  hypothetical protein  41.43 
 
 
146 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2368  hypothetical protein  41.5 
 
 
147 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2247  hypothetical protein  39.46 
 
 
152 aa  120  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100566  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3505  hypothetical protein  43.36 
 
 
170 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1340  hypothetical protein  43.17 
 
 
143 aa  120  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0865  protein of unknown function UPF0153  47.11 
 
 
154 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1322  hypothetical protein  40.79 
 
 
153 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2072  hypothetical protein  39.74 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1432  hypothetical protein  46.62 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1691  hypothetical protein  47.66 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1477  hypothetical protein  48.03 
 
 
152 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0576  hypothetical protein  41.43 
 
 
145 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000050037  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1324  hypothetical protein  44.6 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1667  hypothetical protein  39.46 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000235569  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2441  hypothetical protein  40.71 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2928  conserved hypothetical protein UPF0153 family  44.14 
 
 
163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0597493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1336  hypothetical protein  39.19 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000903587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2074  hypothetical protein  45.32 
 
 
170 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2467  protein of unknown function UPF0153  39.46 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000723255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2170  hypothetical protein  38.78 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858239  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1281  hypothetical protein  39.46 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1325  hypothetical protein  39.46 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2444  hypothetical protein  39.46 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000434719  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1968  hypothetical protein  39.46 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000843778  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2379  hypothetical protein  38.78 
 
 
152 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123307  normal  0.207331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2006  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0150725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2394  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.245355  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2117  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.707271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3366  hypothetical protein  42.96 
 
 
148 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1463  hypothetical protein  41.96 
 
 
148 aa  116  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1382  hypothetical protein  37.06 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.566287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0521  hypothetical protein  48.25 
 
 
147 aa  116  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1801  hypothetical protein  42.74 
 
 
160 aa  115  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.348768  normal  0.297133 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2003  hypothetical protein  40.94 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.808992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2239  hypothetical protein  39.6 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000027257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2000  hypothetical protein  39.46 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0627  hypothetical protein  44.09 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825167  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1943  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000318483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01156  hypothetical protein  38.78 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000316712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01166  hypothetical protein  38.78 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000198247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1632  hypothetical protein  38.81 
 
 
146 aa  114  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000957769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002897  hypothetical protein  39.44 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2181  hypothetical protein  41.13 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.02228  hitchhiker  0.000186068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3057  hypothetical protein  43.7 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03078  hypothetical protein  46.3 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2117  hypothetical protein  41.04 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0677538  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1068  protein of unknown function UPF0153  40.46 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1007  hypothetical protein  44.34 
 
 
190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3355  hypothetical protein  41.41 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0917  hypothetical protein  45.79 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1927  hypothetical protein  39.55 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000323397  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2516  hypothetical protein  38.89 
 
 
146 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  normal  0.84957 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>