122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2928 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2928  conserved hypothetical protein UPF0153 family  100 
 
 		 163 aa  331  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0597493 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0978  hypothetical protein  67.59 
 
 		 153 aa  213  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2303  hypothetical protein  66.9 
 
 		 153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3366  hypothetical protein  63.89 
 
 		 148 aa  200  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2197  hypothetical protein  65.97 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2072  hypothetical protein  57.82 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3663  hypothetical protein  59.72 
 
 		 146 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1024  hypothetical protein  57.14 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0895  hypothetical protein  57.14 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2409  hypothetical protein  55.03 
 
 		 206 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0879  hypothetical protein  56.49 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1358  hypothetical protein  54.93 
 
 		 147 aa  160  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2819  hypothetical protein  58.57 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0887  protein of unknown function UPF0153  56.12 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1340  hypothetical protein  55.4 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1324  hypothetical protein  54.29 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1151  hypothetical protein  52.98 
 
 		 213 aa  157  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.706631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2070  hypothetical protein  57.35 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0898  hypothetical protein  55.4 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1463  hypothetical protein  52.08 
 
 		 148 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1382  hypothetical protein  60.32 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0890  protein of unknown function UPF0153  57.82 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0865  protein of unknown function UPF0153  58.22 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0929  hypothetical protein  57.53 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0453  protein of unknown function UPF0153  53.02 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.604994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3505  hypothetical protein  52.86 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3920  hypothetical protein  52.17 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0286797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1801  hypothetical protein  54.93 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.348768  normal  0.297133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1114  hypothetical protein  55.71 
 
 		 204 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95528  normal  0.301999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1955  hypothetical protein  51.43 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0431  hypothetical protein  55.71 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1477  hypothetical protein  57.85 
 
 		 152 aa  148  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1432  hypothetical protein  54.41 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0721  protein of unknown function UPF0153  52.63 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4092  hypothetical protein  51.8 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1404  hypothetical protein  52.52 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1691  hypothetical protein  57.02 
 
 		 168 aa  147  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0521  hypothetical protein  54.29 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47410  hypothetical protein  51.08 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0895733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1661  protein of unknown function UPF0153  49.29 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1626  hypothetical protein  46.94 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0937096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1301  hypothetical protein  49.64 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0627  hypothetical protein  55.2 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2074  hypothetical protein  50.71 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1740  hypothetical protein  46.85 
 
 		 148 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1776  hypothetical protein  50.36 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.924435  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4587  hypothetical protein  48.92 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1790  hypothetical protein  49.02 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0377386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3057  hypothetical protein  54.2 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1667  hypothetical protein  49.65 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000235569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2529  hypothetical protein  44.6 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4117  hypothetical protein  49.64 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1336  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000903587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1950  hypothetical protein  51.43 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2010  hypothetical protein  51.43 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220539  normal  0.187397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1953  hypothetical protein  51.43 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0472193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1322  hypothetical protein  51.43 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1506  hypothetical protein  51.43 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2467  protein of unknown function UPF0153  49.65 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000723255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1281  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1325  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2444  hypothetical protein  49.65 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000434719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1968  hypothetical protein  49.65 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000843778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1608  hypothetical protein  51.8 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32930  hypothetical protein  50.36 
 
 		 149 aa  141  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3355  hypothetical protein  52.24 
 
 		 132 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1074  hypothetical protein  45.32 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.056354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2854  hypothetical protein  54.33 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2003  hypothetical protein  48.25 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.808992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2000  hypothetical protein  48.57 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3897  hypothetical protein  48.92 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01156  hypothetical protein  48.95 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000316712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3918  hypothetical protein  48.92 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.871403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1567  hypothetical protein  48.92 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01166  hypothetical protein  48.95 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000198247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1068  protein of unknown function UPF0153  48.59 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2368  hypothetical protein  47.86 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2978  hypothetical protein  50.71 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1632  hypothetical protein  46.62 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000957769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0917  hypothetical protein  47.45 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1927  hypothetical protein  45.32 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000323397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1767  hypothetical protein  41.78 
 
 		 157 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000753323  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0171  hypothetical protein  47.71 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000313306  normal  0.665672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2247  hypothetical protein  41.78 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100566  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2006  hypothetical protein  47.55 
 
 		 148 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0150725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2394  hypothetical protein  47.55 
 
 		 148 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.245355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2117  hypothetical protein  47.55 
 
 		 148 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.707271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1392  hypothetical protein  46.76 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2798  hypothetical protein  41.03 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2573  hypothetical protein  43.17 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01143  hypothetical protein  44.08 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2239  hypothetical protein  46.21 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000027257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1327  hypothetical protein  49.65 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1943  hypothetical protein  46.21 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000318483  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2441  hypothetical protein  45.32 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2181  hypothetical protein  41.96 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.02228  hitchhiker  0.000186068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2170  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2379  hypothetical protein  41.1 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123307  normal  0.207331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3515  hypothetical protein  38.04 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.529376  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2280  hypothetical protein  41.14 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179274 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>