34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1985 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1985  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324308  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2191  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378167  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3293  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000889246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2185  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000012204  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1975  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00703448  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1791  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163942  normal  0.445936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0320  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000227247  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0323  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000316141  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0475  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0129202  normal  0.393615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0661  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00198496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0678  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000411933  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0655  IS66 Orf2 family protein  98 
 
 
100 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0132149  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2633  IS66 Orf2 family protein  96 
 
 
119 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2629  IS66 Orf2 family protein  96 
 
 
119 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396747  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2664  IS66 Orf2 family protein  96 
 
 
119 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.553305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2651  IS66 Orf2 family protein  56 
 
 
119 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110169  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2621  IS66 Orf2 family protein  56 
 
 
119 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0157656  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0065  transposase  34.69 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2983  IS66 Orf2 family protein  42 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3053  IS66 Orf2 family protein  44 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6182  IS66 Orf2 like  43.14 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  44.68 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  37.25 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2522  IS66 Orf2 family protein  43.48 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  44.19 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4533  IS66 Orf2 family protein  48.78 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  47.62 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  36 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  47.62 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1004  IS66 Orf2 family protein  35.29 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1617  IS66 Orf2 family protein  35.29 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.841823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0155  hypothetical protein  38 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>