14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1255 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  100 
 
 
562 aa  1065    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  65.22 
 
 
567 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  93.42 
 
 
562 aa  962    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  82.3 
 
 
558 aa  837    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  43.92 
 
 
532 aa  392  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  44.56 
 
 
533 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  42.93 
 
 
538 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  46.23 
 
 
561 aa  378  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  42.63 
 
 
532 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  33.51 
 
 
532 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  34.22 
 
 
531 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  41.33 
 
 
1336 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  32.34 
 
 
535 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  25.34 
 
 
437 aa  46.2  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>