13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0123 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  82.19 
 
 
538 aa  867    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  61.16 
 
 
532 aa  654    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  100 
 
 
532 aa  1052    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  83.11 
 
 
533 aa  884    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  42.38 
 
 
558 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  42.63 
 
 
562 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  41.05 
 
 
567 aa  352  1e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  43.36 
 
 
562 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  36.12 
 
 
561 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  31.61 
 
 
532 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  31.47 
 
 
535 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  31.7 
 
 
531 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  30.58 
 
 
1336 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>