14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1370 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  65.45 
 
 
562 aa  664    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  100 
 
 
567 aa  1107    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  65.91 
 
 
562 aa  658    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  65.4 
 
 
558 aa  644    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  45.44 
 
 
532 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  45.66 
 
 
561 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  40.38 
 
 
538 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  40.7 
 
 
533 aa  353  5e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  41.4 
 
 
532 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  36.29 
 
 
1336 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  31.89 
 
 
532 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  31.3 
 
 
531 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  31.51 
 
 
535 aa  216  9e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  36.25 
 
 
444 aa  45.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>