13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0045 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0683  S-layer protein  60.11 
 
 
538 aa  647    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0742683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0045  S-layer protein  100 
 
 
532 aa  1058    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0123  S-layer protein  61.16 
 
 
532 aa  644    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.539086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1780  S-layer protein  62.48 
 
 
533 aa  677    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.423468  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1370  S-layer protein  45.44 
 
 
567 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  43.92 
 
 
562 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  44.56 
 
 
562 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  43.21 
 
 
558 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  39.22 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  32.37 
 
 
535 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  32.02 
 
 
532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  31.48 
 
 
531 aa  239  9e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  30.11 
 
 
1336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>