17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0035 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0035  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1130  hypothetical protein  93.04 
 
 
273 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0788  hypothetical protein  90.84 
 
 
273 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0853  hypothetical protein  76.47 
 
 
272 aa  428  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0829  hypothetical protein  68.5 
 
 
273 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1440  sugar kinase  36.88 
 
 
292 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993883  normal  0.0279013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3248  hypothetical protein  40.07 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3171  sugar kinase  34.52 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0902  sugar kinase  33.33 
 
 
295 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00167272  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2808  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.71 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  39.44 
 
 
499 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  39.44 
 
 
499 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.49 
 
 
497 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1370  YjeF-related protein  32.94 
 
 
496 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.73 
 
 
533 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.87 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1254  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.04 
 
 
574 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.954739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>