118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0036 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0036  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0020  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156043  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0562  hypothetical protein  88.33 
 
 		 141 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000293219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0007  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000010318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0023  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00977111  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0040  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697667  normal  0.123512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05586  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00107854  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0057  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00632698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0021  tRNA-Gly  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0019  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3086  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0356  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.192081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0060  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0013  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000164045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3188  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0052  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1904  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000012603  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3764  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3826  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.216257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3459  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000712395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000491266  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0106  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281433  hitchhiker  0.00000200758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4287  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.14711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0007  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000568475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0007  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000140906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0062  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0121694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0013  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0010  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2801  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458752  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0007  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000313428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0013  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179187  normal  0.143307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0013  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000407891  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0071  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000687699  normal  0.228297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0089  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00198921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0058  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136383  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0049  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.323662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000038079  hitchhiker  0.00000000000000785716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0082  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000798848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>