17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1608 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1608  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 84 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.492901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2072  Smr protein/MutS2  71.43 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.388741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5354  hypothetical protein  68.29 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.991834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4487  Smr protein/MutS2  61.9 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115386  normal  0.0196105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0437  hypothetical protein  65.43 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447603  hitchhiker  0.0000870611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0367  hypothetical protein  65.43 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.874167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3040  Smr protein/MutS2  64.63 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1051  Smr protein/MutS2  61.45 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1021  hypothetical protein  60.24 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0612  hypothetical protein  55 
 
 		 87 aa  93.6  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4584  Smr protein/MutS2  50.63 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0364  Smr protein/MutS2  42.5 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.732526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  32.91 
 
 		 804 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 		 771 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 817 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1087  Smr protein/MutS2  44.44 
 
 		 817 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  44.44 
 
 		 771 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>