13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1021 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1021  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1051  Smr protein/MutS2  98.81 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4487  Smr protein/MutS2  69.88 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115386  normal  0.0196105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0437  hypothetical protein  68.29 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447603  hitchhiker  0.0000870611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0367  hypothetical protein  69.51 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.874167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3040  Smr protein/MutS2  60.98 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2072  Smr protein/MutS2  60.24 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.388741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5354  hypothetical protein  60.49 
 
 		 83 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.991834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1608  Smr protein/MutS2  60.24 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.492901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0612  hypothetical protein  60.49 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0364  Smr protein/MutS2  43.75 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.732526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4584  Smr protein/MutS2  40.51 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121043 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  41.27 
 
 		 800 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>