12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0612 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0612  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  178  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0367  hypothetical protein  68.29 
 
 
84 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.874167  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0437  hypothetical protein  65.85 
 
 
84 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447603  hitchhiker  0.0000870611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3040  Smr protein/MutS2  64.63 
 
 
84 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566359  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5354  hypothetical protein  65 
 
 
83 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.991834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4487  Smr protein/MutS2  62.2 
 
 
94 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115386  normal  0.0196105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2072  Smr protein/MutS2  60 
 
 
84 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.388741  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1051  Smr protein/MutS2  60.49 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1021  hypothetical protein  60.49 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1608  Smr protein/MutS2  55 
 
 
84 aa  93.6  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.492901  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4584  Smr protein/MutS2  39.24 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0364  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.732526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>