14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4584 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4584  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1608  Smr protein/MutS2  50.63 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.492901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5354  hypothetical protein  48.1 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.991834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0364  Smr protein/MutS2  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.732526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0437  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447603  hitchhiker  0.0000870611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0367  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.874167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2072  Smr protein/MutS2  44.3 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.388741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3040  Smr protein/MutS2  46.99 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1021  hypothetical protein  40.51 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1051  Smr protein/MutS2  40.51 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4487  Smr protein/MutS2  39.76 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115386  normal  0.0196105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0612  hypothetical protein  39.24 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  40.74 
 
 		 771 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4369  Smr protein/MutS2  36.71 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0240999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>