17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1392 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1392  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  408  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113006  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1321  hypothetical protein  51.38 
 
 
216 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0139  hypothetical protein  42.71 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.355206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2253  hypothetical protein  32.32 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.266247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1274  hypothetical protein  38.33 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0197804  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1302  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3546  hypothetical protein  31.36 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0041915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2657  hypothetical protein  29.9 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24661  hypothetical protein  41.57 
 
 
1063 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0035  hypothetical protein  36.24 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2085  hypothetical protein  37.37 
 
 
959 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.85609  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0259  hypothetical protein  32.41 
 
 
928 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  31.78 
 
 
497 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02508  hypothetical protein  26.14 
 
 
437 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  31.78 
 
 
491 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2131  hypothetical protein  33.77 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003551  hypothetical protein  25.26 
 
 
445 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>