20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0117 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0117    100 
 
 		 990 bp  1963    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  83.87 
 
 		 972 bp  71.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  82.26 
 
 		 966 bp  71.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  82.26 
 
 		 966 bp  71.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  82.26 
 
 		 1392 bp  71.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  82.26 
 
 		 1002 bp  71.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 978 bp  63.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 978 bp  63.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  88.68 
 
 		 984 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  88.68 
 
 		 1326 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  88.68 
 
 		 978 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  88.68 
 
 		 1002 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  88.68 
 
 		 990 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  88.68 
 
 		 978 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  88.68 
 
 		 978 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  88.68 
 
 		 978 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  88.68 
 
 		 1494 bp  58  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  94.29 
 
 		 990 bp  54  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  100 
 
 		 990 bp  50.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6851    96.43 
 
 		 676 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>