16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0042 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0045  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.112138  normal  0.31939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0048  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0005  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0062  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0064  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.468559  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt02  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00232285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0042  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0005  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.150884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0007  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0934389 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0703  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>