23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2734 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2961  antenna complex alpha/beta subunit  100 
 
 		 76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.403153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2734  antenna complex alpha/beta subunit  100 
 
 		 76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2856  antenna complex alpha/beta subunit  97.37 
 
 		 76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2814  antenna complex alpha/beta subunit  83.33 
 
 		 78 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474258  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3701  antenna complex alpha/beta subunit  79.22 
 
 		 76 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270474  hitchhiker  0.00274594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6433  light harvesting 1 beta subunit  64.79 
 
 		 77 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2056  antenna complex alpha/beta subunit  59.21 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0173941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1411  antenna complex, alpha/beta subunit  59.68 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3997  antenna complex, alpha/beta subunit  56.92 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35271  normal  0.0140077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3752  antenna complex, alpha/beta subunit  60.32 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348717  hitchhiker  0.00126234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1714  antenna complex alpha/beta subunit  56.92 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2977  antenna complex, alpha/beta subunit  55.93 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1297  antenna complex, alpha/beta subunit  59.32 
 
 		 70 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.724705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1607  antenna complex, alpha/beta subunit  44.93 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2032  antenna complex, alpha/beta subunit  42.5 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1902  antenna complex, alpha/beta subunit  42.5 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0621384  normal  0.411147 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6108  LHI beta, light-harvesting B875 subunit  42.5 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3521  light-harvesting protein B-870 beta chain  42.86 
 
 		 49 aa  50.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.946391  normal  0.159593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0175  antenna complex, alpha/beta subunit  42.86 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1407  antenna complex, alpha/beta subunit  55 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2927  antenna complex alpha/beta subunit  43.18 
 
 		 47 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2610  antenna complex, alpha/beta subunit  40.91 
 
 		 47 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.202435  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2862  antenna complex, alpha/beta subunit  40.91 
 
 		 47 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0341881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>