14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4118 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4118  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  32.65 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  29 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  28 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  28 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  29 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  33.01 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  29.73 
 
 		 320 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  33.66 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  31 
 
 		 176 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  29.13 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  34.23 
 
 		 536 aa  41.2  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>