13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2346 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2346  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
158 aa  324  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222304  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1575  hypothetical protein  55.92 
 
 
160 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0660673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 
244 aa  57.4  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  30.19 
 
 
409 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  29.03 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 
197 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  29.66 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
241 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  26.97 
 
 
146 aa  44.3  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  29.37 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  27.74 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  21.92 
 
 
147 aa  40.8  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>