19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0185 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2913    100 
 
 		 2281 bp  1417    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000174755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0634    100 
 
 		 2234 bp  2270    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0185    100 
 
 		 2161 bp  4284    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2512  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  83.81 
 
 		 1005 bp  440  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.583145  normal  0.39229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2602  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  81.18 
 
 		 999 bp  125  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2221  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  81.01 
 
 		 999 bp  123  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  85.83 
 
 		 1014 bp  109  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000254635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2608  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  80.52 
 
 		 1002 bp  101  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.654237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0542  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  85.92 
 
 		 1014 bp  61.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  81.82 
 
 		 1014 bp  60  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1903  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  82.8 
 
 		 1041 bp  58  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00223597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2650  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  88.46 
 
 		 1023 bp  56  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0990  ABC sugar transporter, periplasmic sugar binding subunit  88.46 
 
 		 1023 bp  56  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0125  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  87.27 
 
 		 1020 bp  54  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3354  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  80.49 
 
 		 1005 bp  54  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0126  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  87.27 
 
 		 1020 bp  54  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.986111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0894  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  88 
 
 		 1002 bp  52  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4581  Monosaccharide-transporting ATPase  87.76 
 
 		 1005 bp  50.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000000318793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  86.79 
 
 		 978 bp  50.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>