14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2069 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2069  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  331  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0376  peptidase domain-containing protein  35.07 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150499  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2161  peptidase domain-containing protein  34.51 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1188  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.982767  decreased coverage  0.0042804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0655  hypothetical protein  37.23 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.760732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3376  hypothetical protein  34.15 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000802171  hitchhiker  0.00821656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2079  hypothetical protein  34.48 
 
 
148 aa  55.1  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0651  hypothetical protein  39.74 
 
 
98 aa  54.3  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1831  hypothetical protein  29.29 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000558666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1271  peptidase domain-containing protein  32.59 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1818  hypothetical protein  28.87 
 
 
140 aa  50.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0465963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1732  hypothetical protein  28.12 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00444689  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0092  hypothetical protein  33.64 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0759  hypothetical protein  30.36 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.30809  normal  0.170766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>