15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0376 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0376  peptidase domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  291  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150499  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2079  hypothetical protein  41.78 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1188  hypothetical protein  42.55 
 
 
138 aa  100  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.982767  decreased coverage  0.0042804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1831  hypothetical protein  35.77 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000558666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0651  hypothetical protein  49.45 
 
 
98 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1818  hypothetical protein  36.5 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0465963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0655  hypothetical protein  45.05 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.760732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3376  hypothetical protein  34.76 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000802171  hitchhiker  0.00821656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1732  hypothetical protein  31.54 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00444689  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2161  peptidase domain-containing protein  34.03 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0759  hypothetical protein  41.98 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.30809  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2069  hypothetical protein  35.07 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1271  peptidase domain-containing protein  45.45 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0092  hypothetical protein  41.05 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1757  hypothetical protein  32.84 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>