16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0655 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0655  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  306  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.760732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0651  hypothetical protein  76.53 
 
 
98 aa  155  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1831  hypothetical protein  46.41 
 
 
140 aa  130  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000558666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1818  hypothetical protein  44.44 
 
 
140 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0465963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1188  hypothetical protein  42.07 
 
 
138 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.982767  decreased coverage  0.0042804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2079  hypothetical protein  41.1 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3376  hypothetical protein  40.38 
 
 
166 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000802171  hitchhiker  0.00821656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2161  peptidase domain-containing protein  40.54 
 
 
150 aa  103  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0376  peptidase domain-containing protein  37.09 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150499  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1271  peptidase domain-containing protein  46.32 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0092  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1732  hypothetical protein  29.45 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00444689  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2069  hypothetical protein  31.17 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  50.85 
 
 
591 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1757  hypothetical protein  33.1 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0759  hypothetical protein  32.26 
 
 
229 aa  51.2  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.30809  normal  0.170766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>