14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0092 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0092  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  246  7e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1271  peptidase domain-containing protein  45.54 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0655  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.760732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0651  hypothetical protein  41.94 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2079  hypothetical protein  39.39 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0376  peptidase domain-containing protein  41.05 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150499  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3376  hypothetical protein  40.59 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000802171  hitchhiker  0.00821656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1188  hypothetical protein  38.71 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.982767  decreased coverage  0.0042804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1831  hypothetical protein  36.26 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000558666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1818  hypothetical protein  36.26 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0465963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2161  peptidase domain-containing protein  38.54 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1732  hypothetical protein  35.48 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00444689  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1757  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2069  hypothetical protein  33.64 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>