29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5233 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5233  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4766  hypothetical protein  98.74 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5308  hypothetical protein  91.6 
 
 		 238 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.969326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0750  hypothetical protein  69.71 
 
 		 241 aa  321  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  27.5 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  27.5 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  28.1 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  28.02 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0126  hypothetical protein  35.27 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  27.08 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  24.02 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  22.58 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  25.66 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  24.31 
 
 		 178 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  24.04 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  50 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  31.75 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  27.48 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  34.62 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  32.88 
 
 		 185 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  22.79 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  22.54 
 
 		 186 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  23.56 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  23.56 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  33.98 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  39.68 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  34.43 
 
 		 169 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  39.06 
 
 		 167 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>