19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2497 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2497  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1193    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.040498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0164  hypothetical protein  61.21 
 
 
400 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1112  hypothetical protein  61.14 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1838  hypothetical protein  34.75 
 
 
361 aa  194  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0377  hypothetical protein  27.24 
 
 
399 aa  98.2  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00965227  normal  0.177253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2408  hypothetical protein  35.8 
 
 
225 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29957  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  63.64 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1520  hypothetical protein  29.61 
 
 
345 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.806192  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.75 
 
 
415 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1350  hypothetical protein  27.18 
 
 
351 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1300  hypothetical protein  25.6 
 
 
333 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11265  normal  0.297989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0240  hypothetical protein  27.06 
 
 
342 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000162309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1825  hypothetical protein  28.7 
 
 
298 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1828  hypothetical protein  31.03 
 
 
363 aa  50.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  29.25 
 
 
431 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  75.86 
 
 
387 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1349  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0142  hypothetical protein  29.17 
 
 
233 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0485  hypothetical protein  32.69 
 
 
255 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00435353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>