15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2408 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2408  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29957  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0240  hypothetical protein  29.89 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000162309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2497  hypothetical protein  33.91 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.040498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1350  hypothetical protein  32.58 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1838  hypothetical protein  28.9 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1825  hypothetical protein  28.17 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1828  hypothetical protein  26.77 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1300  hypothetical protein  29.76 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11265  normal  0.297989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  70.27 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1520  hypothetical protein  28.97 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.806192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1349  hypothetical protein  26.23 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  28.95 
 
 		 431 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  76.67 
 
 		 387 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  76.92 
 
 		 415 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0142  hypothetical protein  26.23 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>