20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3482 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3482  porin  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540068  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  29.03 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  26.69 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  26.69 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  26.69 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  26.69 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  26.69 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  28.45 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  26.69 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  29.6 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  29.6 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  29.6 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  29.48 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  25.56 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  25.56 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  28.24 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  28.24 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  28.24 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  28.24 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  28.24 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>