26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02069 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02069  uncharacterized FlgJ-related protein  100 
 
 
150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0320569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  33.98 
 
 
270 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  33.98 
 
 
270 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.98 
 
 
270 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  37.04 
 
 
275 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  44.78 
 
 
255 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  25.71 
 
 
267 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  36.84 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  31.07 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  31.07 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  31.07 
 
 
270 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  31.07 
 
 
270 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  31.07 
 
 
270 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  28.57 
 
 
290 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  39.73 
 
 
310 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.82 
 
 
286 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  37.31 
 
 
270 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  39.29 
 
 
275 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  38.75 
 
 
275 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  29.35 
 
 
237 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  41.3 
 
 
288 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.88 
 
 
272 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  35.59 
 
 
245 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  40.91 
 
 
259 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  28.92 
 
 
304 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  29.03 
 
 
278 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>