19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3934 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3934  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  156  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362853  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3637  putative transmembrane anti-sigma factor  71.95 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1835  hypothetical protein  41.27 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21560  hypothetical protein  39.68 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1555  putative transmembrane anti-sigma factor  30.99 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0444542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1423  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  39.66 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  34.33 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1547  hypothetical protein  42.55 
 
 		 49 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.539405  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0334  putative transmembrane anti-sigma factor  36.11 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0317  hypothetical protein  30.19 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3621  putative transmembrane anti-sigma factor  42.55 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0680768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3173  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0030247  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2407  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000581897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0035  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3286  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000244624  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1141  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000213136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2369  hypothetical protein  38 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000117975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1500  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0178  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>