106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1763 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1763  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  100 
 
 
141 aa  295  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2614  hypothetical protein  32.62 
 
 
149 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2668  hypothetical protein  32.62 
 
 
149 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951139  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1225  hypothetical protein  35.21 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0307849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2375  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.26 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260674  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458009  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03978  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0961  glyoxalase family protein  28.26 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0310  hypothetical protein  26.53 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0504777 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3920  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4608  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5620  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03939  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4347  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4661  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4572  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4614  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.83 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5678  glyoxalase/bleomycin resistance protein  27.54 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0853542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2336  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2359  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.69 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.69 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6895  glyoxalase family protein  28.67 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.008726  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.88 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.74 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0411  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195958  normal  0.144933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.47 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000310805 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0601  hypothetical protein  25.17 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1646  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.9 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.123315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5402  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.06 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1173  VOC metalloenzyme family protein  26.81 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.71319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4569  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.48 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419653 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3497  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.48 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35175  normal  0.404774 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1941  glyoxalase family protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.758162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.79 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1012  glyoxalase family protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0853  glyoxalase family protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0295  glyoxalase family protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2291  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.82 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.36 
 
 
139 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1165  VOC metalloenzyme family protein  26.09 
 
 
144 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.13 
 
 
137 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.9 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3319  hypothetical protein  22.22 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361879  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  23.7 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.7 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.71 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2309  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000699699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2277  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.9839499999999997e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2231  hypothetical protein  28.47 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5247  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.06 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2484  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000939903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3219  PhnB protein  26.06 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0939991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0941  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.55 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000300848  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2290  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.12 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000395035  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4634  hypothetical protein  25.17 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4634  hypothetical protein  25.17 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.872407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4543  hypothetical protein  25.17 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4550  hypothetical protein  24.49 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4683  hypothetical protein  25.17 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  25.18 
 
 
279 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4170  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2584  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.46 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.91802  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4467  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.26 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358832  normal  0.022389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2043  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.97 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2580  hypothetical protein  27.74 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46780  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00435317  hitchhiker  0.000000369567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3115  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.46 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.358222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2438  hypothetical protein  25.37 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2505  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2613  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.57 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524251 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2515  hypothetical protein  26.12 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2330  hypothetical protein  26.9 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.875189  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4030  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3064  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.46 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1225  hypothetical protein  25.52 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000443563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1324  glyoxalase family protein  25.36 
 
 
260 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228518  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.24 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.128238  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3137  hypothetical protein  25.37 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.55 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4446  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.55 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2770  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.92 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00372425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0826  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.18 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1328  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.3 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346773  normal  0.129541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09360  hypothetical protein  27.46 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.502731  normal  0.891606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5411  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.92 
 
 
141 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.6 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.87 
 
 
313 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0212284  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.36 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2829  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000111266  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  24.06 
 
 
284 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.74 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.867816 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6326  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.31 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629107  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1950  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.29 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.671815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>