44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0810 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0810  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 90 aa  187  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.116128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0375  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  33.9 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  35.29 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4481  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0478  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 74 aa  42  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  35.09 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 77 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0490  hypothetical protein  32.2 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0466  hypothetical protein  32.2 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3598  helix-turn-helix type 3  29.82 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4120  transcriptional regulator, XRE family  25.97 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  32.2 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3870  transcriptional regulator, XRE family protein  29.82 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 89 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  31.58 
 
 		 74 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  31.58 
 
 		 74 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>