59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0914 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0914  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 		 474 aa  939    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0771  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  100 
 
 		 474 aa  939    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.02999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2654  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30 
 
 		 489 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0867  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.42 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06900  purine-cytosine permease-like transporter  26.7 
 
 		 483 aa  90.5  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2142  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.72 
 
 		 453 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1469  purine-cytosine permease or related protein  23.08 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.454286  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2286  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.11 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30600  purine-cytosine permease-like transporter  25.84 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3647  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.81 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2922  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.74 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185419  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4415  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.43 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0291  permease, cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin family  24.01 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2557  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.27 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4136  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.41 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18030  purine-cytosine permease-like transporter  25 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.046034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0158  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.32 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1867  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.27 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3607  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.41 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6281  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.97 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4820  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.57 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2217  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin permease family protein  24.32 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.738305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0460  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.24 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1149  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.88 
 
 		 462 aa  56.6  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451386  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5706  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.43 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  0.11286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2090  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.75 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00352517  normal  0.665422 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5793  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.83 
 
 		 462 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.610023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2267  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.07 
 
 		 468 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2262  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.49 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3641  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  24.12 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2252  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.82 
 
 		 470 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2075  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.6 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3655  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25.6 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0501993  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15160  purine-cytosine permease-like transporter  23.64 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.280122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5614  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.3 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493081  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3261  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.16 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3283  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2248  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.6 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.1498  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10767  Cytosine-purine permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B1PXD0]  22.6 
 
 		 508 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00395029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3034  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.72 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72073  predicted protein  23.21 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7084  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.89 
 
 		 475 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.083974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0564  hypothetical protein  24.4 
 
 		 487 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0125  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.61 
 
 		 448 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1140  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.32 
 
 		 476 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0465  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  27.2 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.446257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2380  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  26.07 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2519  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  26.07 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1795  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  27.2 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0417  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  27.2 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0831  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  26.07 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0628  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  27.2 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1129  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.8 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3697  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.6 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3297  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.21 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3218  transporter membrane subunit  24.15 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1455  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.63 
 
 		 503 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4072  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.74 
 
 		 450 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6647  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  24.78 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104211  normal  0.0424999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1221  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.32 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>