34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3824 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3824  hypothetical protein  100 
 
 		 37 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.620418 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6561  hypothetical protein  67.57 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7067  hypothetical protein  67.57 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368637  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6167  hypothetical protein  67.57 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.087743  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1270  hypothetical protein  67.57 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6549  hypothetical protein  64.86 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6263  hypothetical protein  62.16 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0883  putative transmembrane protein  62.16 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  62.16 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0550  hypothetical protein  59.46 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4166  hypothetical protein  59.46 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2758  hypothetical protein  62.16 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0462  hypothetical protein  59.46 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0808424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2855  hypothetical protein  56.76 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0282  hypothetical protein  56.76 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3192  hypothetical protein  56.76 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0513  hypothetical protein  56.76 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0495  hypothetical protein  56.76 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1428  hypothetical protein  56.76 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0164  hypothetical protein  56.76 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0431  hypothetical protein  56.76 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0678  hypothetical protein  58.82 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4386  putative transmembrane protein  62.16 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6171  hypothetical protein  59.46 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2841  hypothetical protein  59.46 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353606  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2852  hypothetical protein  59.46 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  64.71 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  64.71 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1384  putative transmembrane protein  61.11 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.074752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0266  hypothetical protein  60.61 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1680  putative transmembrane protein  59.46 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1685  hypothetical protein  51.35 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.386414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0319  transmembrane protein  57.58 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0368  hypothetical protein  48.57 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>