15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2748 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2748  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00566814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0799  hypothetical protein  37.97 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1032  hypothetical protein  34.46 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1092  hypothetical protein  34.73 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1084  hypothetical protein  33.86 
 
 		 303 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2380  hypothetical protein  32.77 
 
 		 280 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2141  hypothetical protein  33.73 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2318  hypothetical protein  33.47 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000759583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2218  hypothetical protein  31.78 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62552  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2529  hypothetical protein  32.17 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1796  hypothetical protein  31.97 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2314  hypothetical protein  31.84 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000706585  hitchhiker  0.00708954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2024  hypothetical protein  31.84 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0578959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2072  hypothetical protein  31.84 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.397212  normal  0.175191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2301  hypothetical protein  31.84 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.311954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>