More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0162 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0162  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
253 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.62 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.22 
 
 
249 aa  243  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.22 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.61 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.41 
 
 
249 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.22 
 
 
249 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.82 
 
 
249 aa  241  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.5 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.41 
 
 
249 aa  241  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.41 
 
 
249 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.22 
 
 
249 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.61 
 
 
249 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.41 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.21 
 
 
249 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.61 
 
 
249 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50 
 
 
249 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  52.21 
 
 
249 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.02 
 
 
249 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.21 
 
 
249 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.81 
 
 
249 aa  231  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  52.42 
 
 
249 aa  231  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50 
 
 
249 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.21 
 
 
249 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.4 
 
 
249 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.21 
 
 
249 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.4 
 
 
249 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.82 
 
 
249 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  49.8 
 
 
252 aa  228  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.6 
 
 
249 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  52.42 
 
 
249 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.19 
 
 
249 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.42 
 
 
249 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  52.02 
 
 
249 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.02 
 
 
249 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.02 
 
 
249 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.4 
 
 
249 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  52.42 
 
 
249 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.02 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.02 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.02 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.02 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.02 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.02 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.02 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  51.61 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.02 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.42 
 
 
249 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  50 
 
 
249 aa  224  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.61 
 
 
249 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.61 
 
 
249 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.61 
 
 
249 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.21 
 
 
249 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  49.39 
 
 
249 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  50.41 
 
 
249 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.81 
 
 
249 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  50 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.21 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  49.8 
 
 
249 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.41 
 
 
446 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.4 
 
 
249 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  48.98 
 
 
249 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.37 
 
 
249 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  49.8 
 
 
248 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  49.4 
 
 
251 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  49.8 
 
 
248 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  50 
 
 
267 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.59 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.19 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0250  electron transfer flavoprotein subunit beta EtfB  51.9 
 
 
249 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.19 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.19 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  50 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.76 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  48.99 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.99 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.58 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.76 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.76 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.98 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.4 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  47.6 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.97 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.16 
 
 
249 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  50.2 
 
 
249 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.57 
 
 
249 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  47.22 
 
 
252 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.97 
 
 
252 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1290  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50 
 
 
249 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0308703  normal  0.0442598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50 
 
 
249 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.78 
 
 
249 aa  208  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1752  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.37 
 
 
249 aa  208  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0841122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.56 
 
 
253 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3570  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  49.39 
 
 
249 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  49 
 
 
249 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  47.77 
 
 
249 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  47.77 
 
 
249 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.43 
 
 
250 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.43 
 
 
250 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0727  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.57 
 
 
248 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>