49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1551 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1551  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  621  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0931  hypothetical protein  29.04 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000169212  normal  0.14657 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1658  hypothetical protein  28.62 
 
 
313 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0359207  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0703  hypothetical protein  29.59 
 
 
277 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2196  hypothetical protein  32.73 
 
 
254 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1991  hypothetical protein  31.4 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1807  hypothetical protein  28.4 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1891  hypothetical protein  34.84 
 
 
254 aa  92  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000150124  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1439  hypothetical protein  53.33 
 
 
143 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000731129  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0532  hypothetical protein  25.52 
 
 
274 aa  89.7  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000747481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1906  hypothetical protein  34.52 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1859  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  85.9  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000135384  hitchhiker  0.00000000773634 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2135  hypothetical protein  34.52 
 
 
250 aa  85.9  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2436  hypothetical protein  33.73 
 
 
254 aa  85.9  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0121  hypothetical protein  51.69 
 
 
155 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.295341  hitchhiker  1.79788e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  26.15 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1922  hypothetical protein  38.3 
 
 
190 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.250359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  26.94 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2689  hypothetical protein  35.14 
 
 
130 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  25.8 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  25.8 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  26.83 
 
 
230 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  24 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  25.93 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4962  hypothetical protein  29.59 
 
 
192 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  52  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4981  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  26.5 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1363  hypothetical protein  40.62 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  39.74 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  28.91 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  30.1 
 
 
298 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  22.22 
 
 
311 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  33.63 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  23.55 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  24.56 
 
 
317 aa  45.8  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  36.84 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  23 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1393  hypothetical protein  37.88 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  31.51 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  27.12 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  22.96 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  23.23 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  23.86 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  24.81 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  25.87 
 
 
292 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  34.38 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  36.49 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  44.68 
 
 
313 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>