18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0532 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0532  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000747481 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1658  hypothetical protein  87.59 
 
 
313 aa  511  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0359207  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0703  hypothetical protein  56.72 
 
 
277 aa  297  1e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0931  hypothetical protein  35.36 
 
 
277 aa  161  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000169212  normal  0.14657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1807  hypothetical protein  29.33 
 
 
330 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1551  hypothetical protein  25.52 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2196  hypothetical protein  21.29 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2436  hypothetical protein  23.15 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1991  hypothetical protein  23.15 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1906  hypothetical protein  21.94 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2135  hypothetical protein  21.67 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1891  hypothetical protein  20.69 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000150124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1922  hypothetical protein  25.17 
 
 
190 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.250359  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1413  hypothetical protein  30.08 
 
 
146 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2689  hypothetical protein  24.14 
 
 
130 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1653  hypothetical protein  35.71 
 
 
74 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  40.3 
 
 
289 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0831  hypothetical protein  35.29 
 
 
66 aa  42.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0219668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>