22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1167 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1167  outer-membrane lipoprotein carrier protein  100 
 
 
164 aa  321  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0967  outer-membrane lipoprotein carrier protein  98.17 
 
 
164 aa  316  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0777121  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1021  outer-membrane lipoprotein carrier protein  96.34 
 
 
169 aa  313  5e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.390204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0524  outer-membrane lipoprotein carrier protein  47.56 
 
 
168 aa  150  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0575  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.07 
 
 
171 aa  128  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.307328  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1858  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.61 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.324926  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0724  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.2 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1073  outer-membrane lipoprotein carrier protein  37.01 
 
 
170 aa  111  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00225889  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1389  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.74 
 
 
171 aa  110  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1042  outer-membrane lipoprotein carrier protein  41.14 
 
 
171 aa  102  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.81 
 
 
233 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.91 
 
 
215 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  27.22 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.91 
 
 
215 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1039  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.93 
 
 
244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236245  normal  0.725621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.23 
 
 
244 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.55 
 
 
216 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.95 
 
 
214 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0636  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.09 
 
 
231 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.2 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2599  outer-membrane lipoprotein carrier protein  19.74 
 
 
212 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1562  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.95 
 
 
236 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>