20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1021 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1021  outer-membrane lipoprotein carrier protein  100 
 
 
169 aa  332  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.390204  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0967  outer-membrane lipoprotein carrier protein  96.95 
 
 
164 aa  317  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0777121  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1167  outer-membrane lipoprotein carrier protein  96.34 
 
 
164 aa  313  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0524  outer-membrane lipoprotein carrier protein  48.5 
 
 
168 aa  157  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0575  outer-membrane lipoprotein carrier protein  43.2 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.307328  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0724  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.1 
 
 
168 aa  123  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1858  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.64 
 
 
170 aa  121  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.324926  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1073  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.69 
 
 
170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00225889  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1042  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.01 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1389  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.41 
 
 
171 aa  106  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.22 
 
 
233 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.03 
 
 
219 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.77 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  26.63 
 
 
233 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1039  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.42 
 
 
244 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236245  normal  0.725621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.77 
 
 
215 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.08 
 
 
244 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.98 
 
 
214 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.44 
 
 
216 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0636  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.44 
 
 
231 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>