28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0575 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0575  outer-membrane lipoprotein carrier protein  100 
 
 		 171 aa  343  5e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.307328  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1858  outer-membrane lipoprotein carrier protein  46.15 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.324926  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1073  outer-membrane lipoprotein carrier protein  44.38 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00225889  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0524  outer-membrane lipoprotein carrier protein  43.2 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0724  outer-membrane lipoprotein carrier protein  44.38 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1021  outer-membrane lipoprotein carrier protein  43.2 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.390204  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0967  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.68 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0777121  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1167  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.07 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1389  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.6 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1042  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.84 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.26 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2232  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.12 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25 
 
 		 206 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.02 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1773  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.03 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000455776  hitchhiker  0.00742019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2012  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0324067  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  23.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2010  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.39 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.05 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1964  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.39 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  0.873937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2128  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.25 
 
 		 208 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000303746  normal  0.0168034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2051  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.39 
 
 		 206 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00204466  hitchhiker  0.0003026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2482  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.14 
 
 		 208 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000211708  hitchhiker  0.000000303985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2214  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.09 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2157  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.09 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2322  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.09 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000513903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2192  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.09 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000213674  normal  0.236324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>