13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1829 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1829  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  647    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2931  hypothetical protein  38.62 
 
 
327 aa  192  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0578  hypothetical protein  40.8 
 
 
336 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2328  hypothetical protein  38.01 
 
 
435 aa  165  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.634009  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4268  hypothetical protein  34.38 
 
 
339 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00149177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0978  hypothetical protein  34.42 
 
 
311 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.608417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1149  hypothetical protein  33.43 
 
 
481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0977  hypothetical protein  33.04 
 
 
307 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0183973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4632  hypothetical protein  29.85 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3097  hypothetical protein  30.18 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1476  hypothetical protein  26.53 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1526  hypothetical protein  30.93 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978056  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1949  hypothetical protein  32.54 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0831325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>