13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1526 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1526  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  686    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978056  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2328  hypothetical protein  30.31 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.634009  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2931  hypothetical protein  29.28 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1829  hypothetical protein  30.87 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0578  hypothetical protein  29.95 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0978  hypothetical protein  27.92 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.608417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1149  hypothetical protein  28.78 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4632  hypothetical protein  26.33 
 
 
366 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3097  hypothetical protein  24.84 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4268  hypothetical protein  38.73 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00149177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0977  hypothetical protein  26.99 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0183973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1476  hypothetical protein  37.93 
 
 
316 aa  49.7  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1949  hypothetical protein  28.14 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0831325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>